Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFXL1Q6ZNB6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFXL1Q6ZNB6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms