Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNI2Q6ZMN8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNI2Q6ZMN8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms