Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC23A3Q6PIS1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC23A3Q6PIS1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC23A3Q6PIS1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC23A3Q6PIS1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC23A3Q6PIS1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC23A3Q6PIS1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC23A3Q6PIS1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC23A3Q6PIS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC23A3Q6PIS1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms