Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00242Q5T6M2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00242Q5T6M2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00242Q5T6M2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00242Q5T6M2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00242Q5T6M2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00242Q5T6M2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms