Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms