Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COLEC12Q5KU26 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COLEC12Q5KU26 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COLEC12Q5KU26 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms