Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRRT3Q5FWE3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRRT3Q5FWE3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms