Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HS1BP3Q53T59 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HS1BP3Q53T59 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HS1BP3Q53T59 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HS1BP3Q53T59 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HS1BP3Q53T59 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HS1BP3Q53T59 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms