Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms