Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETDBQ3ZM63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETDBQ3ZM63 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms