Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA3Q16787 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMA3Q16787 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMA3Q16787 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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