Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18Q15532 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SS18Q15532 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SS18Q15532 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18Q15532 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18Q15532 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SS18Q15532 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms