Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1CQ13936 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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