Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RUNX3Q13761 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUNX3Q13761 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUNX3Q13761 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms