Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGCGQ13326 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGCGQ13326 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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