Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3FQ13275 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3FQ13275 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3FQ13275 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms