Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
GRIN2AQ12879 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms