Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EXOSC9Q06265 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EXOSC9Q06265 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms