Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3AQ05086 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3AQ05086 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms