Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPARDQ03181 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARDQ03181 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms