Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD1Q02809 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD1Q02809 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.2 ms