Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX1Q01196 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms