Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPD2P62316 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPD2P62316 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms