Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD23AP54725 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23AP54725 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23AP54725 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAD23AP54725 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD23AP54725 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms