Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF143P52747 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF143P52747 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF143P52747 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms