Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC3P51654 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC3P51654 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPC3P51654 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPC3P51654 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPC3P51654 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC3P51654 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC3P51654 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC3P51654 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC3P51654 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC3P51654 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC3P51654 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC3P51654 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC3P51654 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC3P51654 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC3P51654 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC3P51654 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC3P51654 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.8 ms