Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSC2P49815 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC2P49815 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC2P49815 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC2P49815 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC2P49815 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSC2P49815 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSC2P49815 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC2P49815 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC2P49815 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC2P49815 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC2P49815 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC2P49815 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSC2P49815 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSC2P49815 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSC2P49815 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC2P49815 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC2P49815 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC2P49815 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC2P49815 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSC2P49815 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC2P49815 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC2P49815 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC2P49815 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC2P49815 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSC2P49815 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSC2P49815 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC2P49815 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSC2P49815 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSC2P49815 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSC2P49815 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC2P49815 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC2P49815 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC2P49815 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC2P49815 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSC2P49815 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSC2P49815 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC2P49815 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC2P49815 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC2P49815 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC2P49815 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSC2P49815 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms