Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NESP48681 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NESP48681 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NESP48681 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NESP48681 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NESP48681 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NESP48681 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
NESP48681 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NESP48681 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
NESP48681 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NESP48681 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
NESP48681 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
NESP48681 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
NESP48681 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
NESP48681 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
NESP48681 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NESP48681 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NESP48681 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NESP48681 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NESP48681 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NESP48681 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NESP48681 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NESP48681 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
NESP48681 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NESP48681 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
NESP48681 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NESP48681 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
NESP48681 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
NESP48681 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NESP48681 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NESP48681 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NESP48681 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NESP48681 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NESP48681 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
NESP48681 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
NESP48681 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NESP48681 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
NESP48681 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
NESP48681 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
NESP48681 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
NESP48681 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NESP48681 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NESP48681 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NESP48681 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NESP48681 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NESP48681 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NESP48681 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NESP48681 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
NESP48681 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NESP48681 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NESP48681 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NESP48681 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NESP48681 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NESP48681 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NESP48681 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NESP48681 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NESP48681 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NESP48681 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NESP48681 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NESP48681 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NESP48681 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NESP48681 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NESP48681 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC40.63■■■■■ 4.09
NESP48681 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NESP48681 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
NESP48681 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NESP48681 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NESP48681 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NESP48681 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NESP48681 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NESP48681 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NESP48681 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NESP48681 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NESP48681 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NESP48681 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NESP48681 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NESP48681 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NESP48681 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NESP48681 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NESP48681 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NESP48681 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NESP48681 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NESP48681 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NESP48681 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NESP48681 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NESP48681 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NESP48681 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NESP48681 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
NESP48681 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
NESP48681 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
NESP48681 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
NESP48681 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms