Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMD8P48556 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD8P48556 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms