Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 CBC2YPL178W 627 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 PAF1YBR279W 1338 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 ATG20YDL113C 1923 nt5.7□□□□□ -1.5
VFA1P40080 SLD2YKL108W 1362 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 ADY2YCR010C 852 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YDL121CYDL121C 450 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 IRC7YFR055W 1023 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 EFM4YIL064W 774 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 RPA49YNL248C 1248 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 UBA3YPR066W 900 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 KTR3YBR205W 1215 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 MTF2YDL044C 1323 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 MIF2YKL089W 1650 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 CTS1YLR286C 1689 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 ATE1YGL017W 1512 nt5.69□□□□□ -1.5
VFA1P40080 VMS1YDR049W 1899 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 HXT15YDL245C 1704 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 HXT16YJR158W 1704 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 SYG1YIL047C 2709 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 TDH3YGR192C 999 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 MPM1YJL066C 759 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 APN1YKL114C 1104 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YBL029WYBL029W 1131 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 RPL21BYPL079W 483 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YPR109WYPR109W 885 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 DDC1YPL194W 1839 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YIR007WYIR007W 2295 nt5.68□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YLH47YPR125W 1365 nt5.67□□□□□ -1.5
VFA1P40080 GIP2YER054C 1647 nt5.67□□□□□ -1.5
VFA1P40080 MCM21YDR318W 1107 nt5.67□□□□□ -1.5
VFA1P40080 SPO74YGL170C 1242 nt5.67□□□□□ -1.5
VFA1P40080 SYF2YGR129W 648 nt5.67□□□□□ -1.5
VFA1P40080 PGU1YJR153W 1086 nt5.67□□□□□ -1.5
VFA1P40080 PSR1YLL010C 1284 nt5.67□□□□□ -1.5
VFA1P40080 BIT2YBR270C 1638 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 FRE7YOL152W 1863 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 PHO8YDR481C 1701 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 PHM8YER037W 966 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 SOH1YGL127C 384 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 XPT1YJR133W 630 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 RAD17YOR368W 1206 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 DCC1YCL016C 1143 nt5.66□□□□□ -1.5
VFA1P40080 UTR4YEL038W 684 nt5.65□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YHR127WYHR127W 732 nt5.65□□□□□ -1.5
VFA1P40080 CTR2YHR175W 570 nt5.65□□□□□ -1.5
VFA1P40080 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.65□□□□□ -1.5
VFA1P40080 ARG1YOL058W 1263 nt5.65□□□□□ -1.5
VFA1P40080 NPT1YOR209C 1290 nt5.65□□□□□ -1.5
VFA1P40080 ISU2YOR226C 471 nt5.65□□□□□ -1.5
VFA1P40080 SNM1YDR478W 597 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YGR011WYGR011W 327 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YJL193WYJL193W 1209 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YJL215CYJL215C 360 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YLR194CYLR194C 765 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 RER2YBR002C 861 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 PET20YPL159C 762 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 HES1YOR237W 1305 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 ECM3YOR092W 1842 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 SLT2YHR030C 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
VFA1P40080 ERD1YDR414C 1089 nt5.63□□□□□ -1.51
VFA1P40080 RML2YEL050C 1182 nt5.63□□□□□ -1.51
VFA1P40080 SPC34YKR037C 888 nt5.63□□□□□ -1.51
VFA1P40080 OMA1YKR087C 1038 nt5.63□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YOL050CYOL050C 321 nt5.63□□□□□ -1.51
VFA1P40080 DXO1YDR370C 1329 nt5.63□□□□□ -1.51
VFA1P40080 HXT17YNR072W 1695 nt5.63□□□□□ -1.51
VFA1P40080 SKN1YGR143W 2316 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 ERV14YGL054C 417 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YPT32YGL210W 669 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YIL086CYIL086C 309 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 PRS1YKL181W 1284 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 TIF34YMR146C 1044 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 COQ6YGR255C 1440 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 GAL10YBR019C 2100 nt5.62□□□□□ -1.51
VFA1P40080 HAP1YLR256W 4509 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 RMD5YDR255C 1266 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 FMP48YGR052W 1110 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 UTP9YHR196W 1728 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 MAD3YJL013C 1548 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 MTC2YKL098W 1074 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 MAC1YMR021C 1254 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 CSL4YNL232W 879 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YOL024WYOL024W 519 nt5.61□□□□□ -1.51
VFA1P40080 VPS36YLR417W 1701 nt5.6□□□□□ -1.51
VFA1P40080 CUE2YKL090W 1332 nt5.6□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YDL172CYDL172C 480 nt5.6□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YDL241WYDL241W 372 nt5.6□□□□□ -1.51
VFA1P40080 CBF1YJR060W 1056 nt5.6□□□□□ -1.51
VFA1P40080 MRPL13YKR006C 795 nt5.6□□□□□ -1.51
VFA1P40080 PEX32YBR168W 1242 nt5.6□□□□□ -1.51
VFA1P40080 PRR1YKL116C 1557 nt5.59□□□□□ -1.51
VFA1P40080 MRE11YMR224C 2079 nt5.59□□□□□ -1.51
VFA1P40080 YKL169CYKL169C 384 nt5.59□□□□□ -1.51
VFA1P40080 CTR3YLR411W 726 nt5.59□□□□□ -1.51
VFA1P40080 ADD37YMR184W 597 nt5.59□□□□□ -1.51
VFA1P40080 LCB2YDR062W 1686 nt5.59□□□□□ -1.52
VFA1P40080 PUS1YPL212C 1635 nt5.59□□□□□ -1.52
VFA1P40080 AVT3YKL146W 2079 nt5.59□□□□□ -1.52
VFA1P40080 NOT3YIL038C 2511 nt5.58□□□□□ -1.52
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