Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC12P31275 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC12P31275 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms