Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALRP27797 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALRP27797 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CALRP27797 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CALRP27797 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CALRP27797 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALRP27797 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALRP27797 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CALRP27797 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CALRP27797 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALRP27797 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALRP27797 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALRP27797 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALRP27797 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CALRP27797 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALRP27797 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CALRP27797 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CALRP27797 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALRP27797 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALRP27797 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALRP27797 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALRP27797 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALRP27797 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALRP27797 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALRP27797 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CALRP27797 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALRP27797 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALRP27797 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALRP27797 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALRP27797 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALRP27797 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALRP27797 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALRP27797 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALRP27797 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALRP27797 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALRP27797 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALRP27797 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms