Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP5A1P25705 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5A1P25705 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms