Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFX1P22670 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFX1P22670 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFX1P22670 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFX1P22670 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX1P22670 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX1P22670 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX1P22670 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX1P22670 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX1P22670 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX1P22670 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFX1P22670 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFX1P22670 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX1P22670 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX1P22670 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX1P22670 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX1P22670 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFX1P22670 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX1P22670 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX1P22670 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX1P22670 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX1P22670 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX1P22670 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFX1P22670 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX1P22670 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX1P22670 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX1P22670 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX1P22670 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX1P22670 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFX1P22670 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX1P22670 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX1P22670 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX1P22670 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX1P22670 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX1P22670 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX1P22670 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFX1P22670 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX1P22670 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX1P22670 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX1P22670 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX1P22670 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFX1P22670 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX1P22670 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX1P22670 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX1P22670 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX1P22670 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX1P22670 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFX1P22670 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX1P22670 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX1P22670 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX1P22670 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX1P22670 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFX1P22670 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFX1P22670 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFX1P22670 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX1P22670 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX1P22670 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX1P22670 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFX1P22670 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX1P22670 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX1P22670 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX1P22670 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms