Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHGAP10645 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHGAP10645 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHGAP10645 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHGAP10645 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHGAP10645 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHGAP10645 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHGAP10645 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHGAP10645 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHGAP10645 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHGAP10645 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHGAP10645 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHGAP10645 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHGAP10645 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHGAP10645 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHGAP10645 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CHGAP10645 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHGAP10645 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHGAP10645 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHGAP10645 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHGAP10645 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHGAP10645 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHGAP10645 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHGAP10645 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHGAP10645 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHGAP10645 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHGAP10645 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHGAP10645 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHGAP10645 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHGAP10645 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CHGAP10645 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHGAP10645 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHGAP10645 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHGAP10645 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHGAP10645 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHGAP10645 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHGAP10645 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHGAP10645 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHGAP10645 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHGAP10645 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHGAP10645 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHGAP10645 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHGAP10645 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CHGAP10645 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHGAP10645 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHGAP10645 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHGAP10645 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHGAP10645 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHGAP10645 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHGAP10645 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHGAP10645 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHGAP10645 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHGAP10645 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHGAP10645 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHGAP10645 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHGAP10645 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHGAP10645 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CHGAP10645 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CHGAP10645 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CHGAP10645 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHGAP10645 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHGAP10645 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHGAP10645 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHGAP10645 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHGAP10645 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHGAP10645 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHGAP10645 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHGAP10645 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHGAP10645 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357 ms