Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA6AP0CW24 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA6AP0CW24 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms