Protein–RNA interactions for Protein: P0CL83

STAG3L1, Putative STAG3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L1P0CL83 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STAG3L1P0CL83 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAG3L1P0CL83 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAG3L1P0CL83 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms