Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HLA-DOAP06340 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HLA-DOAP06340 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HLA-DOAP06340 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms