Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN7O94888 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN7O94888 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms