Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX1O43812 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUX1O43812 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX1O43812 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX1O43812 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX1O43812 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX1O43812 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX1O43812 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DUX1O43812 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX1O43812 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX1O43812 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX1O43812 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX1O43812 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX1O43812 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DUX1O43812 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUX1O43812 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUX1O43812 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUX1O43812 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUX1O43812 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DUX1O43812 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX1O43812 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX1O43812 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX1O43812 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX1O43812 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX1O43812 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUX1O43812 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX1O43812 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX1O43812 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX1O43812 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX1O43812 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX1O43812 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUX1O43812 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUX1O43812 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUX1O43812 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUX1O43812 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUX1O43812 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX1O43812 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX1O43812 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX1O43812 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX1O43812 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX1O43812 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX1O43812 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUX1O43812 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX1O43812 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX1O43812 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX1O43812 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX1O43812 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUX1O43812 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUX1O43812 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX1O43812 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX1O43812 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX1O43812 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX1O43812 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX1O43812 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUX1O43812 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX1O43812 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX1O43812 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX1O43812 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX1O43812 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms