Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRTM2O43300 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRTM2O43300 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRTM2O43300 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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