Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAD1O00515 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAD1O00515 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAD1O00515 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAD1O00515 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAD1O00515 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAD1O00515 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAD1O00515 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAD1O00515 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAD1O00515 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAD1O00515 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAD1O00515 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAD1O00515 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAD1O00515 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAD1O00515 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAD1O00515 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAD1O00515 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAD1O00515 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LAD1O00515 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LAD1O00515 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAD1O00515 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAD1O00515 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAD1O00515 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAD1O00515 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAD1O00515 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAD1O00515 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAD1O00515 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAD1O00515 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAD1O00515 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAD1O00515 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAD1O00515 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAD1O00515 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAD1O00515 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAD1O00515 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAD1O00515 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAD1O00515 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAD1O00515 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LAD1O00515 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAD1O00515 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms