Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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