Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO7DNF2Z398 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMO7DNF2Z398 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO7DNF2Z398 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms