Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPK3BL2E5RIL1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms