Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ3A6PVS8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ3A6PVS8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms