Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA6L9A6NEM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms