Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01553A4QN01 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC01553A4QN01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC01553A4QN01 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms