Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF804BA4D1E1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF804BA4D1E1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF804BA4D1E1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms