Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A3GALT2U3KPV4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
A3GALT2U3KPV4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A3GALT2U3KPV4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms